造成性功能障碍的原因大致可以分成三类：生物因素、精神心理因素和文化因素。
1.生物因素
性功能障碍可能由遗传、健康状况、激素水平、年龄、疾病（包括慢性病、神经精神系统疾患、内分泌疾病、生殖器官病变）等多种原因所引起。药物、长期大量酗酒或吸毒者，也会出现性功能障碍。
2.精神心理因素
精神心理因素对性功能的影响比较突出，包括错误的性观念、过去性经历的影响、环境因素、人际关系紧张和各种外界因素所造成的负性情绪等。
3.文化因素
由于宗教和文化背景的影响，某些人对性生活存在偏见（如认为“一滴精十滴血”），认为性交会损耗元气，主观上要放弃或减少性活动，容易造成性压抑。
临床表现
性功能障碍总体上可分为功能性性功能障碍和器质性性功能障碍两大类。男性性功能障碍包括性欲障碍、阴茎勃起障碍、性交障碍和射精障碍。女性性功能障碍包括性欲障碍、性唤起障碍、性高潮障碍、性交疼痛等。
1.性欲障碍
包括性厌恶、性欲低下、性欲亢进。
2.阴茎勃起功能障碍
是指阴茎持续不能达到和维持充分的勃起以获得满意的性生活。
3.性交障碍
性交障碍的临床表现为性交昏厥、性交失语、性交癔病、性交猝死、性交恐惧症等。
4.射精障碍
包括不射精、延迟射精、逆行射精、射精无力、早泄和痛性射精等。其中，不射精症是指阴茎能正常勃起和性交，但是不能射出精液，或是在其他情况下可射出精液，而在阴道内不射精。逆行射精是阴茎能勃起和进行性交活动，并随着性高潮而射精，但精液未能射出尿道口外而逆行经膀胱颈反流入膀胱。
5.性唤起障碍
指持续性或反复发生不能获得和维持足够的性兴奋，表现为主观性兴奋、性器官及身体其他部位性反应的缺失。包括阴道的润滑、阴蒂及阴唇的感觉及阴道平滑肌舒张等作用的减退。
6.性高潮障碍
指经充分的性刺激和性唤起后，仍然发生持续性或反复的达到性高潮困难、延迟或缺如。
7.性交疼痛障碍
包括性交痛（反复或持续性性交时阴道疼痛）、阴道痉挛（反复或持续性阴道外1/3平滑肌不自主痉挛性收缩，干扰阴茎的插入）、非接触式性交痛（由非直接性交活动引发的反复发作或持续性生殖器疼痛）。
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